MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 chromosome

Total Repeats: 152939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018524	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018524	TCAC	2	8	90	97	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018524	TCCC	2	8	98	105	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018524	TGACG	2	10	147	156	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018524	GT	3	6	161	166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018524	ATG	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018524	CGT	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018524	TCC	2	6	383	388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018524	CCA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018524	CACGA	2	10	484	493	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018524	GAC	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018524	CAC	2	6	510	515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018524	CACC	2	8	520	527	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_018524	TTC	2	6	584	589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018524	CCG	2	6	617	622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018524	CTC	2	6	800	805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018524	TCC	2	6	848	853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018524	CTAC	2	8	899	906	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018524	CAG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018524	CGC	2	6	973	978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018524	AAT	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018524	GCT	2	6	1038	1043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018524	TGG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018524	CTG	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018524	CAA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018524	A	6	6	1339	1344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018524	CCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018524	CGC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018524	CGC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018524	ACCCG	2	10	1558	1567	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_018524	AGA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018524	AAAC	2	8	1674	1681	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018524	GTTCGC	2	12	1791	1802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018524	TGTGT	2	10	1824	1833	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018524	CTTTA	2	10	1834	1843	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018524	CGG	2	6	1868	1873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018524	TTTC	2	8	1913	1920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018524	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018524	ATC	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018524	TCGA	2	8	2077	2084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018524	AC	3	6	2091	2096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018524	ACC	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018524	GCGG	2	8	2167	2174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018524	TGT	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018524	GAC	2	6	2381	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
46	NC_018524	GCA	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
47	NC_018524	CGA	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
48	NC_018524	CGT	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
49	NC_018524	GCCTC	2	10	2455	2464	0 %	20 %	20 %	60 %	403507511
50	NC_018524	GTT	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403507511
51	NC_018524	CCT	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
52	NC_018524	CG	3	6	2513	2518	0 %	0 %	50 %	50 %	403507511
53	NC_018524	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507511
54	NC_018524	GC	3	6	2639	2644	0 %	0 %	50 %	50 %	403507511
55	NC_018524	CGGCC	2	10	2662	2671	0 %	0 %	40 %	60 %	403507511
56	NC_018524	CCT	2	6	2689	2694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
57	NC_018524	TCC	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
58	NC_018524	GTG	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507511
59	NC_018524	GCT	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
60	NC_018524	CTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
61	NC_018524	TCC	2	6	2811	2816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
62	NC_018524	GTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
63	NC_018524	CGG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
64	NC_018524	CGG	2	6	3046	3051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
65	NC_018524	ACC	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507511
66	NC_018524	GGA	2	6	3085	3090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507511
67	NC_018524	GCG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
68	NC_018524	AGC	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
69	NC_018524	GGC	2	6	3181	3186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
70	NC_018524	GCA	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
71	NC_018524	GTCG	2	8	3302	3309	0 %	25 %	50 %	25 %	403507511
72	NC_018524	AGGA	2	8	3342	3349	50 %	0 %	50 %	0 %	403507511
73	NC_018524	C	6	6	3449	3454	0 %	0 %	0 %	100 %	403507511
74	NC_018524	GGCC	2	8	3478	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	403507511
75	NC_018524	GGTC	2	8	3610	3617	0 %	25 %	50 %	25 %	403507511
76	NC_018524	TCG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
77	NC_018524	ATG	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507511
78	NC_018524	CT	3	6	3675	3680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018524	CCT	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018524	ACG	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018524	GTC	2	6	3874	3879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018524	CAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507512
83	NC_018524	CAC	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507512
84	NC_018524	CCT	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507512
85	NC_018524	TCG	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
86	NC_018524	CGC	3	9	4095	4103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
87	NC_018524	CCT	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507512
88	NC_018524	TCGACC	2	12	4180	4191	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403507512
89	NC_018524	GAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403507512
90	NC_018524	GAGCG	2	10	4220	4229	20 %	0 %	60 %	20 %	403507512
91	NC_018524	GGT	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507512
92	NC_018524	CTTC	2	8	4326	4333	0 %	50 %	0 %	50 %	403507512
93	NC_018524	GCC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
94	NC_018524	CCG	2	6	4479	4484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
95	NC_018524	CCG	2	6	4496	4501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
96	NC_018524	CCG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
97	NC_018524	ATCG	2	8	4549	4556	25 %	25 %	25 %	25 %	403507512
98	NC_018524	GGC	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507512
99	NC_018524	CGT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
100	NC_018524	CG	3	6	4663	4668	0 %	0 %	50 %	50 %	403507512
101	NC_018524	TCC	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507512
102	NC_018524	TGC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
103	NC_018524	TCG	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
104	NC_018524	GTCG	2	8	4789	4796	0 %	25 %	50 %	25 %	403507513
105	NC_018524	GCC	2	6	4805	4810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507513
106	NC_018524	CGA	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507513
107	NC_018524	CGCC	2	8	4845	4852	0 %	0 %	25 %	75 %	403507513
108	NC_018524	CCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507513
109	NC_018524	CGT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507513
110	NC_018524	GGA	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507513
111	NC_018524	GTT	2	6	5110	5115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403507513
112	NC_018524	GAG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507513
113	NC_018524	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507513
114	NC_018524	CGG	2	6	5239	5244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507513
115	NC_018524	GGA	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507513
116	NC_018524	CGA	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507513
117	NC_018524	CGC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507514
118	NC_018524	ATC	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507514
119	NC_018524	TCC	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507515
120	NC_018524	ATC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507515
121	NC_018524	TCG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
122	NC_018524	TGC	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
123	NC_018524	CCAGG	2	10	5680	5689	20 %	0 %	40 %	40 %	403507515
124	NC_018524	CTGG	2	8	5692	5699	0 %	25 %	50 %	25 %	403507515
125	NC_018524	GAG	3	9	5714	5722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
126	NC_018524	CAC	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507515
127	NC_018524	TGGTCC	2	12	5802	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
128	NC_018524	CGA	3	9	5836	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507515
129	NC_018524	GCCG	2	8	5847	5854	0 %	0 %	50 %	50 %	403507515
130	NC_018524	GACATC	2	12	5909	5920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403507515
131	NC_018524	ACC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507515
132	NC_018524	AGG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
133	NC_018524	GAG	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
134	NC_018524	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507515
135	NC_018524	GGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
136	NC_018524	GAG	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
137	NC_018524	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507515
138	NC_018524	GCT	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
139	NC_018524	TCTCGA	2	12	6263	6274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018524	CGTC	2	8	6325	6332	0 %	25 %	25 %	50 %	403507516
141	NC_018524	CGG	2	6	6397	6402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507516
142	NC_018524	GTC	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507516
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151	NC_018524	TCC	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507516
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259	NC_018524	TCG	3	9	10520	10528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507519
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265	NC_018524	A	6	6	10954	10959	100 %	0 %	0 %	0 %	403507520
266	NC_018524	GCC	2	6	11088	11093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_018524	GGC	2	6	11104	11109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_018524	GCT	2	6	11202	11207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507521
269	NC_018524	GCG	2	6	11246	11251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507521
270	NC_018524	GC	3	6	11283	11288	0 %	0 %	50 %	50 %	403507521
271	NC_018524	GGGC	2	8	11291	11298	0 %	0 %	75 %	25 %	403507521
272	NC_018524	C	6	6	11384	11389	0 %	0 %	0 %	100 %	403507521
273	NC_018524	GGC	2	6	11419	11424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507521
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277	NC_018524	CGG	2	6	11493	11498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507521
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294	NC_018524	ACC	2	6	12463	12468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507522
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298	NC_018524	GTG	3	9	12592	12600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507522
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302	NC_018524	GGT	2	6	12702	12707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507522
303	NC_018524	CGA	2	6	12731	12736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507522
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379	NC_018524	GCGG	2	8	15241	15248	0 %	0 %	75 %	25 %	403507525
380	NC_018524	GAT	2	6	15283	15288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507525
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383	NC_018524	GAC	2	6	15343	15348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507525
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389	NC_018524	CGGCGT	2	12	15690	15701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403507525
390	NC_018524	CCT	2	6	15711	15716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507525
391	NC_018524	GGC	3	9	15739	15747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507525
392	NC_018524	CGG	2	6	15756	15761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507525
393	NC_018524	CGT	2	6	15765	15770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507525
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395	NC_018524	GGCG	2	8	15798	15805	0 %	0 %	75 %	25 %	403507525
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